สโมสรฟุตบอลสกลนคร เป็นสโมสรฟุตบอลอาชีพในประเทศไทยโดยเป็นทีมจากจังหวัดสกลนคร ก่อตั้งทีมขึ้นเมื่อปี 2548เพื่อส่งทีมลงแข่งขันโปรลีก ปี 2549 โดยในรอบคัดเลือกรอบแรก จ.สกลนคร และ จ.ขอนแก่นได้เป็นตัวแทนภาคอีสาน ไปแข่งรอบสุดท้าย โดยคัดเอาภาคละ 2 ทีม รวมเป็น 10 ทีมโดยในรอบสุดท้าย จ.สกลนคร ได้ขอรับเป็นเจ้าภาพจัดการแข่งขันโดยในรอบสุดท้าย จะเอาแชมปและรองแชมป์ขึ้นไปเล่นในโปรลีก ปี 2549 ต่อไปจ.สกลนครสามารถผ่านเข้าไปชิงชนะเลิศกับ จ.พิษณุโลก ทำให้ทั้ง 2ทีมสามารถขึ้นไปเล่นในโปรลีก ปี 2549 ได้สำเร็จและในโปรลีกปี 2549 นี้ มีทีมเข้าร่วมแข่งขันทั้งหมด 16 ทีม เอาทีมตกชั้น 2ทีม สกลนครได้อันดับที่ 13 หนีตกชั้นได้สำเร็จตามเป้าหมายในปีแรกต่อมาปี2550 จึงเปลี่ยนการแข่งขันจากโปรลรก เป็น ไทยลีกดิวิชั่น 1 โดยมีทีมเข้าร่วมแข่งขันทั้งหมด 24ทีม แบ่งเป็น 2สายสายละ 12 ทีม แต่ละสายเอาทีมตกชั้นทั้งหมด 5ทีม โดยสกลนครอยู่ร่วมสาย A ทำอันดับได้อันดับ 10 ของสาย A ทำให้ต้องตกชั้นลงมาเล่นในดิวิชั่น 2 และปัจจุบันกำลังเล่นอยู่ในลีกดิวิชั่น 2